Микобиота клубней картофеля, выращенных в Камчатском крае

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

В данной работе проведено изучение видового разнообразия грибов, выделенных из пораженных болезнями клубней картофеля, выращенных в Камчатском крае. Определение видовой принадлежности показало, что 44 из 48 изученных штаммов относились к отделу Ascomycota (классы Dothideomycetes, Sordariomycetes, Saccharomycetes, Orbiliomycetes) и четыре штамма – к отделу Basidiomycota (класс Agaricomycetes). Анализ видовой принадлежности показал их принадлежность к следующим видам: аскомицеты – Boeremia exigua, B. foveata, Clonostachys rosea, C. solani, Fusarium avenaceum, F. merismoides, F. oxysporum, F. sporotrichioides, F. torulosum, Geotrichum candidum, Helminthosporium solani, Orbilia oligospora, Plectosphaerella sp., Trichocladium solani, Verticillium albo-atrum, Volutella sp.; базидиомицеты – Sistotrema brinkmannii, Rhizoctonia solani AG-3, Ceratobasidium sp. AG-I. Исследование показало, что среди патогенов преобладают широко распространенные во всех картофелеводческих регионах виды Boeremia exigua и B. foveata, Rhizoctonia solani, Helminthosporium solani, Trichocladium solani, Fusarium spp. Штаммы этих видов отличались достаточно высокой патогенностью. В то же время были выделены и виды, ранее на картофеле не отмечавшиеся. Среди них были отмечены как непатогенные для тканей клубня картофеля (Sistotrema brinkmannii, Ceratobasidium sp. AG-I, F. merismoides) так и слабопатогенный Volutella sp. Штаммы Arthrobotrys oligospora находили на клубнях, пораженных нематодой. Для более полного понимания ассоциированной с картофелем микобиоты необходимо продолжение исследований в неизученных районах Камчатского края и российского Дальнего Востока в целом.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Д. Н. Скоков

Российский университет дружбы народов

Автор, ответственный за переписку.
Email: qases-0987@yandex.ru
Россия, 117198 Москва

А. А. Цинделиани

Российский университет дружбы народов

Email: archil7876@yandex.ru
Россия, 117198 Москва

О. И. Хасбиуллина

Камчатский научно-исследовательский институт сельского хозяйства – филиал ФИЦ “Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н. И. Вавилова (ВИР)”

Email: khasbiullina@kamniish.ru
Россия, 684033 Камчатский край

В. В. Гайнатулина

Камчатский научно-исследовательский институт сельского хозяйства – филиал ФИЦ “Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н. И. Вавилова (ВИР)”

Email: vera30.10@mail.ru
Россия, 684033 Камчатский край

С. Н. Еланский

Российский университет дружбы народов; Московский Государственный Университет им. М. В. Ломоносова

Email: snelansky@mail.ru
Россия, 117198 Москва; 119991 Москва

Е. М. Чудинова

Российский университет дружбы народов

Email: chudiel@mail.ru
Россия, 117198 Москва

Список литературы

  1. A’Hara D. Detection and identification of Phoma pathogens of potato. Meth. Mol. Biol. 2015. V. 1302. P. 17–27. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2620-6_2
  2. Alam M.W., Malik A., Rehman A. et al. First report of potato wilt caused by Plectosphaerella cucumerina in Pakistan. J. Plant. Pathol. 2021. V. 103. P. 687. https://doi.org/10.1007/s42161-021-00771-y
  3. Belosokhov A., Yarmeeva M., Kokaeva L. et al. Trichocladium solani sp. nov. – a new pathogen on potato tubers causing yellow rot. J. Fungi. 2022. V. 8. e1160. https://doi.org/10.3390/jof8111160
  4. Belosokhov A.F., Yarmeeva M.M., Mislavsky S.M. et al. Mycobiota of potato tubers. Mikologiya i fitopatologiya. 2023. Vol. 57(2). P. 123–133. (In Russ.). https://doi.org/10.31857/S0026364823020046
  5. Chudinova E.M., Kokaeva L. Yu., Elansky S.N. et al. The occurrence of thiabendazole-resistant isolates of Helminthosporium solani on potato seed tubers in Russia. J. Plant Dis. Protect. 2020. V. 127. P. 421–423. http://dx.doi.org/10.1007/s41348-020-00313-1
  6. Díaz-Nájera J.F., Ayvar-Serna S., Vargas-Hernández M. et al. First report of Ceratobasidium sp. causing root rot of Crotalaria juncea in Mexico. New Dis. Rep. 2023. V. 47. e12165. https://doi.org/10.1002/ndr2.12165
  7. Elansky A.S., Mislavskiy S.M., Chudinova E.M. et al. Fusarium species affecting potato tubers and tomato fruits in Uganda. Mikologiya i fitopatologiya. 2024. V. 58 (2). P. 163–174. http://dx.doi.org/10.31857/S0026364824020077
  8. Elansky S.N., Chudinova E.M., Elansky A.S. et al. Microorganisms in spent water-miscible metalworking fluids as a resource of strains for their disposal. J. Cleaner Production. 2022. V. 350. e131438. https://doi.org/10.1016/j.jclepro.2022.131438
  9. FAO. 2022. https://www.fao.org/faostat/en/#data/FBS. Accessed 15.11.2024.
  10. Gao J., Zhang Y.Y., Zhao X.J. et al. First report of Potato wilt caused by Plectosphaerella cucumerina in Inner Mongolia, China. Plant Dis. 2016. V. 100 (12). P. 2523. https://doi.org/10.1094/PDIS-01-16-0028-PDN
  11. Gavrilova O., Orina A., Trubin I. et al. Identification and pathogenicity of fusarium fungi associated with dry rot of potato tubers. Microorganisms. 2024. V. 12 (3). P. 598. http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms12030598.
  12. Innis M.A., Gelfand D.H., Sninsky J.J. et al. PCR Protocols: A guide to methods and applications. Academic Press, San Diego, 1990. P. 315.
  13. Kokaeva L.Y., Yarmeeva M.M., Kokaeva Z.G. et al. Phylogenetic study of Alternaria potato and tomato pathogens in Russia. Diversity. 2022. V. 14 (8). P. 685. https://doi.org/10.3390/d14080685
  14. Kopina M.B., Uvarova D.A., Shukhin D.I. et al. On some pycnidial fungi on vegetative potatoes in the Non-Black Earth Region of central Russia. Fitosanitariya. Karantin rasteniy. 2021. N3. P. 27–39. (In Russ.). https://doi.org/10.69536/FKR.2021.49.59.001
  15. Kutuzova I.A., Kokaeva L.Y., Pobendinskaya M.A. et al. Resistance of Helminthosporium solani strains to selected fungicides applied for tuber treatment. J. Plant Pathol. 2017. V. 99 (3). P. 635–642. http://dx.doi.org/10.4454/jpp.v99i3.3950
  16. Loit K., Soonvald L., Astover A. et al. Temporal and cultivar-specific effects on potato root and soil. Fungal Diversity. 2020. V.10 (10). e1535. https://doi.org/10.3390/agronomy10101535
  17. Mardanova A., Lutfullin M., Hadieva G. et al. Structure and variation of root-associated microbiomes of potato grown in alfisol. World J. Microbiol. Biotechnol. 2019. V. 35 (12). P. 181. https://link.springer.com/article/10.1007/s11274-019-2761-3
  18. Meng P.P., Liu X., Qiu H.Z. et al. Fungal population structure and its biological effect in rhizosphere soil of continuously cropped potato. Ying Yong Sheng tai xue bao – The Journal of Applied Ecology. 2012. V. 23 (11). P. 3079–3086.
  19. O’Donnell K., Kistler H.C., Cigelnik E. et al. Multiple evolutionary origins of the fungus causing Panama disease of banana: Concordant evidence from nuclear and mitochondrial gene genealogies. PNAS. 1998. V. 95 (5). P. 2044–2049. https://doi.org/10.1073/pnas.95.5.2044
  20. Pilipova Yu., Shaldyaeva E. Monitoring of pests as a basis for phytosanitary optimization of potato agroecosystems. Innovatsii i prodovolstvennaya bezopasnost. 2019. N1. P. 42–50. (In Russ.).
  21. Potatosystem. 2024. https://potatosystem.ru/kartofelevodstvo-dalnevostochnyj-federalnyj-okrug. Accessed 15.11.2024.
  22. Qin S., Yeboah S., Xu X. et al. Analysis on fungal diversity in rhizosphere soil of continuous Cropping potato subjected to different furrow-ridge mulching managements. Front. Microbiol. 2017. V. 10 (8). Art. 845. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00845
  23. Xie T., Shen S., Hao Y. et al. Comparative analysis of microbial community diversity and dynamics on diseased tubers during potato storage in different regions of Qinghai China. Front. Genet. 2022. V. 13. e818940. https://doi.org/10.3389/fgene.2022.818940
  24. Yarmeeva M., Kutuzova I., Kurchaev M. et al. Colletotrichum species on cultivated Solanaceae crops in Russia. Agriculture 2023. V. 13. P. 511. https://doi.org/10.3390/agriculture13030511
  25. Yarmeeva M.M., Kokaeva L.Y., Chudinova E.M. et al. Anastomosis groups and sensitivity to fungicides of Rhizoctonia solani strains isolated from potato in Russia. J. Plant Dis. Prot. 2021. V. 128. P. 1253–1261. http://dx.doi.org/10.1007/s41348-021-00490-7
  26. Zhang X., Zhang H., Jiang Z. et al. A new strain of Volutella citrinella with nematode predation and nematicidal activity, isolated from the cysts of potato cyst nematodes in China. BMC Microbiol. 2021. V. 21. P. 323. https://doi.org/10.1186/s12866-021-02385-x
  27. Zheng J., Yao L., Liu C. et al. First report of Ceratobasidium sp. AG-I (binucleate Rhizoctonia) causing root rot of Hedychium coronarium Koen in China. Can. J. Plant Pathol. 2023. V. 45 (2). P. 168–175. https://doi.org/10.1080/07060661.2022.2162607
  28. Белосохов А.Ф., Ярмеева М.М., Миславский С.М. и др. (Belosokhov et al.) Микобиота клубней картофеля. // Микология и фитопатология. 2023. Т. 57. № 2. С. 123–133.
  29. Копина М.Б., Уварова Д.А., Шухин Д.И. и др. (Kopina et al.) О некоторых пикнидиальных грибах на вегетирующем картофеле в Нечерноземье средней полосы России // Фитосанитария. Карантин растений. 2021. № 3. С. 27–39.
  30. Пилипова Ю., Шалдяева Е. (Pilipova, Shaldyaeva) Мониторинг вредных организмов как основа фитосанитарной оптимизации агроэкосистем картофеля // Инновации и продовольственная безопасность. 2019. № 1. С. 42–50.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Патогенность штаммов в тесте на ломтиках картофеля. Красным показан диаметр поражения на седьмые сут инкубации при 25°C, серым – седьмые сут инкубации при 10°C, синим – прирост колонии за вторую неделю инкубации. На рисунке приведены только штаммы, проявившие патогенные свойства.

Скачать (47KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Филограмма грибов рода Fusarium, построенная на основании анализа части гена tef 1α. Построено в программе MegaX с использованием алгоритма наибольшего правдоподобия ML.

Скачать (45KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2025